Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBFD1O14562 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms