Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac1O09106 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hdac1O09106 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hdac1O09106 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac1O09106 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms