Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PbsnO08976 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PbsnO08976 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PbsnO08976 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PbsnO08976 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PbsnO08976 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PbsnO08976 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms