Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckarO08786 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckarO08786 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckarO08786 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckarO08786 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckarO08786 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckarO08786 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckarO08786 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckarO08786 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CckarO08786 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckarO08786 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckarO08786 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckarO08786 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckarO08786 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckarO08786 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckarO08786 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckarO08786 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckarO08786 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckarO08786 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckarO08786 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckarO08786 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckarO08786 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckarO08786 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckarO08786 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckarO08786 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckarO08786 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckarO08786 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckarO08786 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckarO08786 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckarO08786 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CckarO08786 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CckarO08786 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CckarO08786 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CckarO08786 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CckarO08786 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CckarO08786 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CckarO08786 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CckarO08786 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CckarO08786 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CckarO08786 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CckarO08786 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CckarO08786 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CckarO08786 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms