Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3FO00303 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3FO00303 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms