Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP1O00294 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP1O00294 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP1O00294 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP1O00294 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP1O00294 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP1O00294 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP1O00294 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP1O00294 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP1O00294 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP1O00294 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP1O00294 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP1O00294 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP1O00294 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP1O00294 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP1O00294 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP1O00294 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP1O00294 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP1O00294 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP1O00294 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP1O00294 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP1O00294 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP1O00294 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP1O00294 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP1O00294 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP1O00294 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP1O00294 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP1O00294 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TULP1O00294 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP1O00294 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP1O00294 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP1O00294 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP1O00294 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP1O00294 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP1O00294 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP1O00294 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP1O00294 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP1O00294 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP1O00294 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP1O00294 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP1O00294 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP1O00294 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP1O00294 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP1O00294 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP1O00294 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms