Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3542K7N6U2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3542K7N6U2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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