Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ccdc180J3QNE4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc180J3QNE4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ccdc180J3QNE4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ccdc180J3QNE4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc180J3QNE4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms