Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17535J3KMR8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm17535J3KMR8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17535J3KMR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms