Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lcG5E8I7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp17lcG5E8I7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17lcG5E8I7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lcG5E8I7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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