Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pnmal2G3X9N3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pnmal2G3X9N3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms