Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Arfgef1G3X9K3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arfgef1G3X9K3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfgef1G3X9K3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms