Protein–RNA interactions for Protein: G3UWZ4

Vmn2r55, Vomeronasal 2, receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r55G3UWZ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r55G3UWZ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r55G3UWZ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r55G3UWZ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms