Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
5830473C10RikF8VQ07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms