Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ercc6F8VPZ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ercc6F8VPZ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Ercc6F8VPZ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ercc6F8VPZ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms