Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col22a1E9Q7P1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col22a1E9Q7P1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms