Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2010300C02RikE9Q3M9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2010300C02RikE9Q3M9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2010300C02RikE9Q3M9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2010300C02RikE9Q3M9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms