Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
4930523C07RikE9Q2T4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930523C07RikE9Q2T4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930523C07RikE9Q2T4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930523C07RikE9Q2T4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms