Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt90E9Q1Z0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt90E9Q1Z0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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