Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
2610021A01RikE9Q0Q3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms