Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Piezo1E2JF22 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Piezo1E2JF22 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms