Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
1110002E22RikE0CYV9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
1110002E22RikE0CYV9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms