Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm10110D3Z5M2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10110D3Z5M2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10110D3Z5M2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms