Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7257D3YX25 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7257D3YX25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7257D3YX25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7257D3YX25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7257D3YX25 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7257D3YX25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7257D3YX25 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms