Protein–RNA interactions for Protein: D3YWE3

Vmn2r84, MCG21564, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r84D3YWE3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r84D3YWE3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r84D3YWE3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms