Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930444P10RikD3YUR1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444P10RikD3YUR1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms