Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DGG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DGG1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DGG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
B4DGG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DGG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DGG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DGG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DGG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DGG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DGG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DGG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DGG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DGG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DGG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DGG1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DGG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DGG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DGG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DGG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DGG1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DGG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DGG1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DGG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DGG1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DGG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DGG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DGG1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DGG1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DGG1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DGG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4DGG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DGG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DGG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms