Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6133B2RY53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6133B2RY53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms