Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd34aB2RW11 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd34aB2RW11 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd34aB2RW11 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd34aB2RW11 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd34aB2RW11 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms