Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ythdc2B2RR83 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ythdc2B2RR83 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ythdc2B2RR83 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ythdc2B2RR83 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms