Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfx1B1AY10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfx1B1AY10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms