Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1P1A8MUH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms