Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm16430A6X8J1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm16430A6X8J1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms