Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBAL3A6NHL2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBAL3A6NHL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBAL3A6NHL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms