Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA6L4A6NEF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms