Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prss40A6H6T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prss40A6H6T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prss40A6H6T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prss40A6H6T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms