Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
EFCAB5A4FU69 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
EFCAB5A4FU69 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
EFCAB5A4FU69 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
EFCAB5A4FU69 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
EFCAB5A4FU69 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
EFCAB5A4FU69 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
EFCAB5A4FU69 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
EFCAB5A4FU69 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EFCAB5A4FU69 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EFCAB5A4FU69 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms