Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc38A3KMP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc38A3KMP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms