Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll9A2APC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll9A2APC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms