Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd4A2AKM2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hacd4A2AKM2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms