Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm13941A2AJ38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm13941A2AJ38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms