Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms