Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Prdm2A2A7B5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Prdm2A2A7B5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Prdm2A2A7B5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Prdm2A2A7B5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prdm2A2A7B5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms