Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdr2lA2A6T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdr2lA2A6T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms