Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm27029A2A4P4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm27029A2A4P4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms