Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200 ms