Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms