Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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