Protein–RNA interactions for Protein: V9GXS8

Gm11983, Predicted gene 11983, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11983V9GXS8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm11983V9GXS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11983V9GXS8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11983V9GXS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm11983V9GXS8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms