Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQA8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQA8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQA8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQA8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQA8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQA8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQA8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQA8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQA8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQA8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQA8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQA8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQA8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQA8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQA8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQA8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQA8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQA8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQA8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQA8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQA8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQA8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQA8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQA8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQA8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQA8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQA8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQA8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQA8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQA8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQA8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQA8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQA8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQA8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQA8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQA8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQA8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQA8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQA8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQA8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms